自序卷上痈疽原委论痈疽治法总论治病则例歌痈疽灸法并禁灸疮穴论病生死法察形色顺逆病有三因受病主治不同论调理须知杂忌须知疮疡看法肿疡治法溃疡治法痈疽诸症疮名十律炼元明粉法取蟾酥法制附子法制炒诸药仙方活命饮
序上卷本症治法兼症治法变症治法疠疡类症本症治验类症治验中卷续治诸症下卷各症方药
论治法论伤各要害处不治论用药论各穴要害之处论验轻重伤诀论用药要诀论各伤主方
年序曹序胡序张序姚序目论目议外障外障治法内障内障治法小儿痘毒眼治法小儿疳积眼治法治小儿雀目法附刻薛氏选方
简介序卷一卷二卷三卷四卷五卷六卷七卷八卷九跋
本草纲目别名录
叙言卷一脏腑经络先后病脉证第一痉湿病脉证第二卷二百合狐惑阴阳毒病证治第三疟病脉证并治第四中风历节病脉证并治第五卷三血痹虚劳病脉证并治第六肺痿肺痈咳嗽上气病脉证治第七卷四奔气病证治第八胸痹心痛短气病脉证
上卷总论类妇人九证论难易上卷经脉类经脉之本经脉诸脏病因经不调调经论外备用方血热经早血热论外方血热经迟血寒经迟血寒论外方血虚经乱肾虚经乱经期腹痛经痛论外方崩淋经漏不止治崩淋经漏之法崩漏论外方杀血心痛热入
第1部分第2部分第3部分第4部分
本草图经序本草图经奏敕玉石上品卷第一玉屑玉泉（图缺），文具玉屑条下。丹砂空青曾青（图缺），文附空青条下。绿青扁青，文具绿青条下。石胆云母石钟乳殷孽，文具石钟乳条下。孔公孽，文具石钟乳条下。石花，文具石