伤寒微旨论
序自叙卷一朝廷对于医者之医方卷二世界对于医者之医方卷三医者自医之医方
述古斋医书叙叙二叙三叙四叙五凡例卷一·辨证觇神气审形色诊面察眼察耳察唇口察齿察鼻准验舌苔诊指纹察手足听声按胸腹询溲便候脉卷二·立法按法摩法掐法揉法推法运法搓法摇法汗法吐法下法针法灸法法砭法浴法法疏表法
自序卷之一痈疽之源（一）痈疽之别（二）脉法（三）分经络（四）善恶（五）虚实（六）内消（七）内托（八）灸（九）针烙（十）砭镰（十一）敷贴(十二）淋洗（十三）将护（十四）禁忌（十五）肿疡(十六)发表辛凉解
弁言杨序总评卷上卷下书《人身图说》后书《医林改错》后书《医林改错》后读《全体新论》
自序凡例卷一阴阳水火气血论男女异同论脏腑病机论脉证死生论用药宜忌论本书补救论卷二吐血呕血咯血唾血咳血鼻衄脑衄目衄耳衄齿衄舌衄大衄零腥吐脓卷三汗血血箭血痣血瘙疮血创血跌打血卷四便血便脓尿血经血崩带产血卷
铜人鍼灸经
序退思集类方歌注麻黄汤类麻黄汤麻黄加术汤麻黄杏仁甘草石膏汤麻黄杏仁薏苡甘草汤越脾汤越脾加术汤越脾加半夏汤大青龙汤小青龙汤小青龙加石膏汤甘草麻黄汤麻黄附子汤麻黄附子细辛汤麻黄连翘赤小豆汤麻黄升麻汤浓朴麻
卷一用药弊端说卷一各症辩认阴阳用药法眼心病不安肺病咳嗽肺痿肺痈胃病不食脾病呕吐泄泻肝病筋挛肾病腰痛头痛目病耳病肿痛鼻流清涕鼻孔煽动唇口红肿齿牙肿痛口臭[附:口苦、口酸、口辛、口甘、口淡、口糜]舌肿、舌
叙卷上诊法常以平旦望色常宜定静明堂周身部位明堂六部提纲面貌分应脏腑五官分应五脏五色分应五脏相气十法提纲望法阴阳总纲五色相应提纲五色主病提纲部色主病提纲四时望法相参四时气色主病昼夜阴晴相参五方望法相参气