序序八穴灸法头部二穴手部二穴背腹部二穴足部二穴梓桑君针道传宗图（缺）百穴法歌折量法补泻手法穴法图寅手太阴肺经卯手阳明大肠经辰足阳明胃经巳足太阴脾经午手少阴心经未手太阳小肠经申足太阳膀胱经酉足少阴肾经戌
自序卷之一痈疽门痈疽原委论第一痈疽治法总论第二痈疽阳症歌第三痈疽阴症歌第四痈疽半阴半阳症歌第五痈疽五善歌第六痈疽七恶歌第七治病则例歌第八痈疽灸法并禁灸疮穴第九论病生死法第十察形色顺逆第十一病有三因受病
类中肝风眩晕头痛咳嗽吐血失音肺痿虚劳遗精淋浊尿血小便闭癃
自序卷上 辨证瘴疟形状人身肖天地瘴疟类天时受病之源瘴疟伤寒辨瘴疟内伤辨诸疟瘴疟辨伤寒瘴疟分南北辨瘴疟五脏俱病冷瘴热瘴瘴不治症脉日期妇人小儿发瘴时调理却病法瘴病中将息法瘴病后将息法灸法瘴后变症痢肿胀痰治
序卷之一脉经序学诊例总论脉式三部分位六经所属五脏所属五脏本脉体六经本脉体五脏传变病脉六经中伤病脉五用乖违病脉脉偶名状七表病脉八里病脉九道病脉卷之二太医习业五科凡例纪用备论脏腑配天地论三因论外所因论叙中
旅舍备要方
简介卷一卷二卷三卷四卷五卷六卷七卷八卷九卷十
卷上痘疹发微惊风卷中论望色论芤脉论人参论犀角杂记卷下三疟治验神水治验制神水秘法妇科验方
本草纲目别名录
叙上卷一、太极图抄引二、太极图（图缺）三、太极图说四、不知《易》者不足以言太医论五、问三才所同者于人身何以见之六、命门图说（图缺）七、右肾水火辩九、《难经正义》三焦评附：东垣三焦论十、问诊三焦包络十一